Статистический способ анализа данных, полученных при помощи методов секвенирования (чтения ДНК) нового поколения, который поможет исследователям изучать геном (весь набор генов) опухолевых клеток, и разработать персонализированное лечение, был представлен на Общем совещании по вопросам статистики (Joint Statistical Meetings) в 2015 году в Сиэтле.
Юань Цзи (Yuan Ji), директор Программы по вычислительной геномике (Program for Computational Genomics) из Чикагского университета (University of Chicago), описывает новую технологию, которая называется «Байесовской моделью неоднородности злокачественных опухолей человека» (Bayesian Models for Heterogeneity in Human Cancers).
Успешность разработки персонализированного лечения рака будет зависеть от точного определения генов опухолевых клеток у конкретного пациента. Последние исследования в области геномики рака показывают, что клетки в каждой отдельной опухоли генетически неоднородные, в их ДНК возникают новые мутации.
Традиционные подходы к лечению рака не позволяют уничтожить все субклоны, – следующие поколения опухолевых клеток, возникающих из одного клона, – в пределах одной опухоли. После терапии оставшиеся клетки приобретают устойчивость и формируют новую опухоль, лечить которую становится еще сложнее.
Таким образом, очень важно изучить все субклоны и назначить комбинированное лечение из препаратов, которые полностью уничтожат их. Первым шагом нужно обнаружить все субклоны и определить мутации, которые в них происходят.
Доктор Цзи с коллегами разработали модель функции распределения Байеса для определения количества и частоты популяций субклонов в опухолевой ткани. Они также изучили мутации в отдельных субклонах. Это поможет врачам, опираясь на разработанные модели, выбирать необходимое сочетание препаратов.
Во время выступления доктор Цзи сказал:
«Надеемся, мы сможем понять генетическую и клеточную неоднородность в каждой отдельной опухоли, облегчив задачу врача по подбору наиболее эффективной терапии для конкретного пациента».
Персонализированное лечение рака возможно уже сегодня. Современные технологии позволяют составить «молекулярный отпечаток» опухоли и определить ее чувствительность к химиопрепаратам.
Европейская онкологическая клиника сотрудничает с американской лабораторией Caris, в которой проводится такое исследование. Мы можем отправить материал, собранный у нашего пациента, в США для молекулярной расшифровки опухоли методами доказательной медицины. Это поможет определить все возможные варианты лечения и выбрать тот, от которого можно ожидать наибольшей эффективности.
Источник: www.sciencedaily.com
Читайте также:
круглосуточно
и событий клиники
